Родился Степан Дмитриевич Прутков 1 января 1911 года в городе Опочке Радомской губернии (ныне Польская Народная Республика). Но вскоре же после рождения Степана его мать переехала в Рославль. Здесь Степан окончил восемь классов и стал работать грузчиком. Учебу он продолжал в вечерней школе рабочей молодежи, а закончив ее, поступил на курсы сортировщиков льна. Работал по специальности на станции Починок. Здесь вступил в комсомол. Осенью 1931 года Пруткова перевели в Смоленск на профсоюзную работу. В августе 1933 года он был призван в Красную Армию. Его направили в Оренбургское военно-авиационное училище, после окончания которого оставили летчиком-инструктором. В училище Степан Дмитриевич стал коммунистом.
В белорусском городе Лида на видном месте установлен памятник-самолет. Он воздвигнут в честь воинов 1-й гвардейской Сталинградской штурмовой авиационной дивизии. На самолете-памятнике изображены орден Ленина, два ордена Красного Знамени, ордена Суворова и Кутузова. Этих наград соединение было удостоено за массовые подвиги его личного состава в годы Великой Отечественной войны. Только в 76-м гвардейском штурмовом авиационном полку выросли три дважды Героя Советского Союза и 22 Героя Советского Союза. В дивизии были командирами эскадрилий смоляне - Герои Советского Союза Ф. С. Бойцов, И. Г. Воробьев и Г. П. Викторов. А командовал этим прославленным соединением Герой Советского Союза полковник С. Д. Прутков. Известный летчик-штурмовик М. Г. Гареев в книге "Самолеты идут на цель" в 1972 году так писал о своем командире: "...Превосходным летчиком был и наш командир дивизии полковник, ныне генерал-лейтенант авиации С. Д. Прутков. Он умел душевно поговорить с подчиненными, летал на задания, водил большие группы самолетов, и авторитет его был высок и непререкаем..."

...С первых дней вероломного нападения гитлеровской Германии на нашу страну капитан Прутков стал водить в бой эскадрилью бомбардировщиков. На машинах устаревших конструкций, часто без прикрытия истребителей, советские летчики, не щадя своей жизни, сдерживали натиск вражеских полчищ. За три месяца боевых действий эскадрилья Пруткова уничтожила 307 автомашин, 25 танков, 13 броневиков, 6 артиллерийских батарей и до 25 зенитных точек.

Зимой 1942 года капитана Пруткова направили переучиваться. Быстро освоив технику пилотирования штурмовика Ил-2, он участвует в боях на Волховском фронте. В июне 1942 года часть, в которой служил Степан Дмитриевич, перебросили в район Сталинграда.
7 сентября 1942 года Степан Дмитриевич водил девятку "ильюшиных" для нанесения удара по скоплению танков и автомашин противника в районе Винновка - Томилин. Сквозь ураганный огонь зенитных батарей летчики прорвались к цели и накрыли ее бомбами и реактивными снарядами. Захватчики потеряли 10 танков и 30 автомашин. Внезапно со стороны солнца показалось несколько "мессершмиттов". Прутков построил группу в круг и принял бой. Воздушные стрелки отражали атаки стервятников, не подпуская их на близкое расстояние. Выбрав удобный момент, майор Прутков повернул машину в сторону врага и первой же очередью сбил истребитель Ме-109. Второго гитлеровца, бросившегося на выручку, уничтожил ведомый. Атаки фашистов прекратились. Вся группа без потерь вернулась на свой аэродром.
Через несколько дней Степан Прутков возглавлял эскадрилью самолетов Ил-2, штурмовавшую танки и пехоту противника в районе Верхней Ельшанки. На подступах к цели советских летчиков атаковало шесть "мессершмиттов". Отражая их атаки, С. Прутков продолжал выполнять задание. Он произвел несколько заходов, бомбами и огнем из пушек уничтожил 10 танков, 14 автомашин и, не имея потерь, увел эскадрилью за линию фронта. И так изо дня в день.

8 декабре 1942 года Степана Дмитриевича Пруткова назначили командиром авиационного полка. Под его руководством летчики совершили 949 успешных боевых вылетов, уничтожив большое количество живой силы и техники противника.
В начале 1943 года командование представило майора С. Д. Пруткова за мужество и геройство, проявленные при защите Ленинграда и Сталинграда, к званию Героя Советского Союза. Командующий 8-й воздушной армией генерал-майор авиации Т. Т. Хрюкин (будущий генерал-полковник, дважды Герой Советского Союза) на наградном листе написал: "Майор Прутков является выдающимся летчиком-штурмовиком и командиром..." Указом Президиума Верховного Совета СССР от 1 мая 1943 года майору Пруткову Степану Дмитриевичу было присвоено звание Героя Советского Союза.
Командуя полком и дивизией, Прутков участвовал в боях за освобождение Крыма, Белоруссии, громил фашистов в Восточной Пруссии, где и застало его окончание Великой Отечественной войны.

После окончания Великой Отечественной войны Степан Дмитриевич продолжил службу в вооружённых силах СССР. Окончив в 1949 году Высшую военную академию Генерального штаба имени К.Е.Ворошилова С. Д. Прутков служил на различных команд-ных должностях в военно-воздушных силах СССР. Степан Дмитриевич также активно участвовал в общественной жизни страны. Он избирался депутатом Верховного Совета Украинской ССР, в качестве делегата участвовал в работе XXII съезда КПСС. В период с 1964 года по 1971 год был начальником командного факультета Военно-Воздушной академии имени Ю.А. Гагарина. В отставку Степан Дмитриевич вышел в 1971 году в звании генерал-лейтенанта. Жил в городе Москве.

10 апреля 1978 года С. Д. Прутков скончался. Похоронен на Кунцевском кладбище столицы.

Награды: